Dans The Bureau – XCOM Declassified, nous sommes en 1962. John F. Kennedy est actuellement président des États-Unis et la guerre froide maintient le pays en haleine. Mais soudain, une menace complètement différente de celle du communisme se profile. En tant qu'agent d'une organisation gouvernementale secrète, appelée The Bureau, vous enquêtez d'abord sur des attaques mystérieuses, dont l'origine apparaît vite plus qu'évidente : les extraterrestres attaquent la Terre en masse ! Combattez ces extraterrestres envahisseurs avec les codes de trainer et les triches de PLITCHet sauvez l'humanité d'un destin terrible.